Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms