Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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