Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.171e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-24■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 TNS1-214ENST00000479185 2513 ntTSL 513.17□□□□□ -0.34e-8■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-210ENST00000528039 764 ntTSL 312.18□□□□□ -0.461e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 PSMF1-207ENST00000435720 319 ntTSL 59.71□□□□□ -0.864e-8■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-205ENST00000396059 1983 ntTSL 1 (best)8.85□□□□□ -0.993e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.023e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.053e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC8.07□□□□□ -1.121e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 PSMF1-210ENST00000484891 4030 ntTSL 27.95□□□□□ -1.144e-8■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.143e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 522.54■■□□□ 1.27e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 AC112178.1-202ENST00000446720 427 ntTSL 35.91□□□□□ -1.465e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.465e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 SEPT9-225ENST00000589250 527 ntTSL 210.56□□□□□ -0.724e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 232.37■■■□□ 2.779e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)32.34■■■□□ 2.779e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-218ENST00000505370 809 ntTSL 226.55■■□□□ 1.849e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-205ENST00000464570 968 ntTSL 326■■□□□ 1.759e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 CALCOCO2-209ENST00000507076 767 ntTSL 325.6■■□□□ 1.699e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-208ENST00000473511 1332 ntTSL 525.27■■□□□ 1.649e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MRPS24-202ENST00000414932 1727 ntTSL 224.75■■□□□ 1.559e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.71■■□□□ 1.559e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PBX2-202ENST00000478678 1320 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.539e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 FANCA-221ENST00000566889 2201 ntTSL 1 (best)24.41■■□□□ 1.59e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 BRAF-202ENST00000469930 1058 ntTSL 222.94■■□□□ 1.269e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ZCCHC11-217ENST00000524582 539 ntTSL 422.2■■□□□ 1.149e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RECQL4-202ENST00000524998 686 ntTSL 321.98■■□□□ 1.119e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.119e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 521.83■■□□□ 1.099e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.991e-12■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ZCCHC11-208ENST00000470626 883 ntTSL 321.12■□□□□ 0.979e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ZCCHC11-210ENST00000473856 2047 ntTSL 1 (best)20.92■□□□□ 0.949e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TAPBP-235ENST00000437116 1239 ntTSL 1 (best)20.29■□□□□ 0.841e-12■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.829e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.819e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MAEA-209ENST00000506530 5371 ntTSL 219.76■□□□□ 0.759e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.759e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RECQL4-207ENST00000534538 725 ntTSL 319.73■□□□□ 0.759e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-222ENST00000507229 2582 ntTSL 219.67■□□□□ 0.749e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.729e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.699e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TAPBP-240ENST00000480730 2202 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.661e-12■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 219.18■□□□□ 0.669e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.669e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.69e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.69e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TUT1-201ENST00000278279 533 ntTSL 418.64■□□□□ 0.579e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 518.63■□□□□ 0.579e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.569e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.569e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.569e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.529e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.59e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 518.06■□□□□ 0.489e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.479e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MAEA-215ENST00000512289 2426 ntTSL 217.96■□□□□ 0.469e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.399e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 AKAP1-207ENST00000572156 710 ntTSL 517.45■□□□□ 0.389e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.389e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-12■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.349e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.339e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 516.91■□□□□ 0.39e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.299e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.259e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 216.23■□□□□ 0.199e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MRPS24-204ENST00000467084 729 ntTSL 216.19■□□□□ 0.189e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-208ENST00000513781 759 ntTSL 316.18■□□□□ 0.189e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ZCCHC11-214ENST00000484723 2910 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.169e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.159e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 215.95■□□□□ 0.149e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.139e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-12■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 215.61■□□□□ 0.099e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 215.42■□□□□ 0.069e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.049e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.029e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 215□□□□□ -0.019e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-210ENST00000515060 433 ntTSL 314.78□□□□□ -0.049e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.19e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.139e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TAPBP-237ENST00000467025 751 ntTSL 314.11□□□□□ -0.151e-12■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 313.84□□□□□ -0.199e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 513.8□□□□□ -0.29e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 H2AFZ-205ENST00000527366 435 ntTSL 313.75□□□□□ -0.219e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.259e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 513.39□□□□□ -0.279e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 413.23□□□□□ -0.299e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 GAB3-201ENST00000369568 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.22□□□□□ -0.299e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)13.02□□□□□ -0.339e-6■■□□□ 13.3
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