Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A1Q14973 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms