Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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