Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPOCK1Q08629 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms