Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms