Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms