Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms