Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms