Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VBP1P61758 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VBP1P61758 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms