Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms