Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX9P55771 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms