Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAPAP54920 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NAPAP54920 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAPAP54920 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAPAP54920 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAPAP54920 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NAPAP54920 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAPAP54920 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAPAP54920 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAPAP54920 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAPAP54920 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAPAP54920 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAPAP54920 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAPAP54920 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms