Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLK1P49759 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLK1P49759 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms