Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms