Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms