Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms