Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms