Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO2P25791 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO2P25791 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO2P25791 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO2P25791 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO2P25791 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO2P25791 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms