Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPREP23469 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms