Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALB2P22676 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALB2P22676 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms