Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms