Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CREB1P16220 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CREB1P16220 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms