Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMBP08118 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms