Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAF4O95104 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms