Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITM2AO43736 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITM2AO43736 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms