Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms