Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms