Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L12C9JPN9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L12C9JPN9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms