Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms