Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms