Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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