Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL2Q9Y467 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL2Q9Y467 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL2Q9Y467 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL2Q9Y467 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms