Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms