Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms