Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms