Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED5Q9Y3A6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms