Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBNO2Q9Y2G9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms