Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms