Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms