Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEFF2Q9UIK5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms