Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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