Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms