Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms