Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAR1AQ9NR31 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms