Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms