Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM4Q9C037 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms