Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
BCO2Q9BYV7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms