Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms